Hồ sơ dự thầu của các doanh nghiệp bị phát hiện có nhiều chi tiết giống nhau đến kỳ lạ. Tại gói thầu số RT3-17-04-01-1/1 tuyến đường Bình Yên (Nam Định) có 5 nhà thầu nộp hồ sơ. Trong quá trình thẩm định, Ban quản lý dự án 6 đã phát hiện hồ sơ dự thầu của Công ty Cổ phần Xây dựng Trực Ninh và Công ty Cổ phần Xây dựng Xuân Quang có chỗ sai giống nhau. Cụ thể, trong khi hồ sơ mời thầu yêu cầu “xây gạch chỉ vữa XM M75 tường đầu cống” thì trong hồ sơ của cả 2 doanh nghiệp này đều là “xây gạch chỉ vữa XM M100 tường đầu cống”.

Vì vậy, Bộ Giao thông và Vận tải quyết định xử phạt nặng 26 nhà thầu thuộc Dự án Giao thông nông thôn 3 tại các tỉnh Lào Cai, Hà Giang và Quảng Ngãi với hình thức cấm tham gia đấu thầu trong vòng 1 năm đối với các dự án, 3 năm với dự án do Ngân hàng Thế giới tài trợ và phạt tiền 20 triệu đồng do có hành vi thông thầu.